Titre : | Actinobactéries endophytes des écosystèmes sahariens : isolement, caractérisation et biocontrôle de Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici, agent causal de la pourriture racinaire et du collet de la tomate (Solanum lycopersicum L.) | Type de document : | texte manuscrit | Auteurs : | Miyada Zaamoum, Auteur ; Abdelghani Zitouni, Auteur | Editeur : | Alger : école normal supérieure de Kouba | Année de publication : | 2016 | Importance : | 164 p. | Format : | 27 cm. | Accompagnement : | 1 disque optique numérique (CD-ROM) | Note générale : | Option : Microbiologie appliquée | Langues : | Français | Mots-clés : | Actinobactéries endophytes Espèces sahariennes Biocontrôle Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici Tomate PGPB Formulation | Résumé : | Ce travail a pour objectifs d’utiliser des actinobactéries endosymbiotiques isolées à partir de 13 espèces sahariennes dans le biocontrôle de Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici (Forl), et d’étudier leur effet sur la promotion de la croissance des plantules de tomate. Comparativement à l’action d’un biofongicide (Sérénade®) et d’un fongicide chimique systémique (Tébuconazole), les isolats les plus actifs ont été sélectionnés et les principaux mécanismes de biocontrôle et de la promotion de la croissance des plantules sont évalués. Les deux isolats les plus performants ont été formulés en trois types de biofongicides différents. Ces derniers ont été testés in vivo pour leur efficacité de biocontrôle et de la promotion de la croissance des plantules de tomate. Quarante et une actinobactéries endosymbiotiques ont été isolées. Les études morphologiques et chimiotaxonomiques ont permis d’attribuer la majorité des isolats au genre Streptomyces. Un screening de biocontrôle in vitro de la pourriture racinaire et du collet de la tomate cv. Marmande causée par Forl, a été effectué. Après bactérisation des semences par les spores des actinobactéries, le pouvoir de chaque isolat à réduire l’incidence de la maladie a été évalué en se référant à l’action du Sérénade® et celle du Tébuconazole. Quinze isolats actifs ont été sélectionnés pour un screening de biocontrôle in vivo. Le biocontrôle et l’effet PGPB in vivo ont été effectués en sol sableux stérilisé ou non stérilisé. Les résultats ont montré que 9 isolats (ZL2, CA2, TL2, AP4, DN4, CA13, TL4, PT2, AR2) ont réduit significativement l’incidence de la maladie. Cependant, les résultats de l’effet PGPB sur les plantules de tomate étaient variables selon les isolats. Une analyse en composantes principales a permis de sélectionner, parmi les actinobactéries étudiées, les isolats les plus efficaces. Les principaux mécanismes de biocontrôle et de l’effet PGPB ont été étudiés pour les 9 isolats sélectionnés. Les résultats ont montré que Streptomyces spp. ZL2 et CA2 présentent une action antagoniste importante contre Forl. Pour l’isolat ZL2, l’analyse par bioautographie a montré la présence d’un seul composé antifongique, efficace contre l’agent phytopathogène. En outre, la majorité des isolats sont capables de produire des chitinases, des protéases, des cellulases, des β 1-3 glucanases, de l’HCN et des sidérophores. Le test du pouvoir colonisateur racinaire a montré que tous les isolats d’actinobactéries sont des endophytes.
La majorité de ces isolats sont aptes à produire l’acide indole 3-acétique, l’acide gibbérellique, l’ACCdésaminase et à libérer l’ammoniaque. Seulement les isolats ZL2 et CA2, peuvent solubiliser les trois formes de phosphates inorganiques étudiées. L’utilisation des phosphates tricalciques solubilisés par l’isolat ZL2, a permis de constater un effet remarquable sur la croissance des plantules de tomate cv. Marmande en culture hors sol. La taxonomie moléculaire et l’étude phylogénétique ont permis de rapprocher l’isolat Streptomyces sp. ZL2 à Streptomyces caeruleatus GIMN4T/GQ329712 et l’isolat Streptomyces sp. CA2 à Streptomyces mutabilis non connus dans le biocontrôle et la bioferlilisation. La formulation des biofongicides a montré que l’utilisation des biofongicides en poudre de talc à base des spores des isolats ZL2 et CA2, séparément, a donné la meilleure efficacité de biocontrôle de l’agent phytopathogène et de l’effet PGPB. Cependant, ces deux isolats combinés sont moins efficaces.
A l’issue de cette étude, les isolats ZL2 et CA2 ont montré une bonne efficacité de biocontrôle de Forl et de l’effet PGPB et elles ouvrent des perspectives très attractives en lutte biologique. |
Actinobactéries endophytes des écosystèmes sahariens : isolement, caractérisation et biocontrôle de Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici, agent causal de la pourriture racinaire et du collet de la tomate (Solanum lycopersicum L.) [texte manuscrit] / Miyada Zaamoum, Auteur ; Abdelghani Zitouni, Auteur . - Alger : école normal supérieure de Kouba, 2016 . - 164 p. ; 27 cm. + 1 disque optique numérique (CD-ROM). Option : Microbiologie appliquée Langues : Français Mots-clés : | Actinobactéries endophytes Espèces sahariennes Biocontrôle Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici Tomate PGPB Formulation | Résumé : | Ce travail a pour objectifs d’utiliser des actinobactéries endosymbiotiques isolées à partir de 13 espèces sahariennes dans le biocontrôle de Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici (Forl), et d’étudier leur effet sur la promotion de la croissance des plantules de tomate. Comparativement à l’action d’un biofongicide (Sérénade®) et d’un fongicide chimique systémique (Tébuconazole), les isolats les plus actifs ont été sélectionnés et les principaux mécanismes de biocontrôle et de la promotion de la croissance des plantules sont évalués. Les deux isolats les plus performants ont été formulés en trois types de biofongicides différents. Ces derniers ont été testés in vivo pour leur efficacité de biocontrôle et de la promotion de la croissance des plantules de tomate. Quarante et une actinobactéries endosymbiotiques ont été isolées. Les études morphologiques et chimiotaxonomiques ont permis d’attribuer la majorité des isolats au genre Streptomyces. Un screening de biocontrôle in vitro de la pourriture racinaire et du collet de la tomate cv. Marmande causée par Forl, a été effectué. Après bactérisation des semences par les spores des actinobactéries, le pouvoir de chaque isolat à réduire l’incidence de la maladie a été évalué en se référant à l’action du Sérénade® et celle du Tébuconazole. Quinze isolats actifs ont été sélectionnés pour un screening de biocontrôle in vivo. Le biocontrôle et l’effet PGPB in vivo ont été effectués en sol sableux stérilisé ou non stérilisé. Les résultats ont montré que 9 isolats (ZL2, CA2, TL2, AP4, DN4, CA13, TL4, PT2, AR2) ont réduit significativement l’incidence de la maladie. Cependant, les résultats de l’effet PGPB sur les plantules de tomate étaient variables selon les isolats. Une analyse en composantes principales a permis de sélectionner, parmi les actinobactéries étudiées, les isolats les plus efficaces. Les principaux mécanismes de biocontrôle et de l’effet PGPB ont été étudiés pour les 9 isolats sélectionnés. Les résultats ont montré que Streptomyces spp. ZL2 et CA2 présentent une action antagoniste importante contre Forl. Pour l’isolat ZL2, l’analyse par bioautographie a montré la présence d’un seul composé antifongique, efficace contre l’agent phytopathogène. En outre, la majorité des isolats sont capables de produire des chitinases, des protéases, des cellulases, des β 1-3 glucanases, de l’HCN et des sidérophores. Le test du pouvoir colonisateur racinaire a montré que tous les isolats d’actinobactéries sont des endophytes.
La majorité de ces isolats sont aptes à produire l’acide indole 3-acétique, l’acide gibbérellique, l’ACCdésaminase et à libérer l’ammoniaque. Seulement les isolats ZL2 et CA2, peuvent solubiliser les trois formes de phosphates inorganiques étudiées. L’utilisation des phosphates tricalciques solubilisés par l’isolat ZL2, a permis de constater un effet remarquable sur la croissance des plantules de tomate cv. Marmande en culture hors sol. La taxonomie moléculaire et l’étude phylogénétique ont permis de rapprocher l’isolat Streptomyces sp. ZL2 à Streptomyces caeruleatus GIMN4T/GQ329712 et l’isolat Streptomyces sp. CA2 à Streptomyces mutabilis non connus dans le biocontrôle et la bioferlilisation. La formulation des biofongicides a montré que l’utilisation des biofongicides en poudre de talc à base des spores des isolats ZL2 et CA2, séparément, a donné la meilleure efficacité de biocontrôle de l’agent phytopathogène et de l’effet PGPB. Cependant, ces deux isolats combinés sont moins efficaces.
A l’issue de cette étude, les isolats ZL2 et CA2 ont montré une bonne efficacité de biocontrôle de Forl et de l’effet PGPB et elles ouvrent des perspectives très attractives en lutte biologique. |
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