A comparative genomics study of Sinorhizobium spp. strains highlighting the molecular mechanisms underlying partner specificity in rhizobia-legume symbiosis / Mohamed Abdenour Rezzoug

Public ISBD Titre : A comparative genomics study of Sinorhizobium spp. strains highlighting the molecular mechanisms underlying partner specificity in rhizobia-legume symbiosis Type de document : document multimédia Auteurs : Mohamed Abdenour Rezzoug, Auteur ; Fathi Berrabah, Directeur de thèse ; Asma Rezzoug, Directeur de thèse Editeur : Laghouat : Université Amar Telidji - Département de biologie Année de publication : 2025 Importance : 50 p. Accompagnement : 1 disque optique numérique (CD-ROM) Note générale : Option : Microbiologie Langues : Anglais Mots-clés : Rhizobia  Nodules  Plant phenolic compounds  Bacterial conjugation  Symbiosis Résumé : Bacteria from the genus Sinorhizobium can form a symbiotic relationship with various leguminous plants, such as the model legume Medicago truncatula. This plant-microbe association induces the formation of specialized plant organs called root nodules, inside which the bacteria perform symbiotic nitrogen fixation (SNF). Among the methods of controlling the symbiotic process by the plant is the secretion of phenolic compounds (PCs), which acts as signaling molecules and have a potential role in modulating bacterial communities as a defense mechanism during symbiotic nodulation. This study aims to elucidate some of the molecular mechanisms involved in the selection of plant growth promoting Rhizobacteria (PGPR) by the host and factors determining symbiont specificity. Phenolic acid bioassays coupled with a comparison of the Pan-Genome of various Sinorhizobium spp. strains revealed key differences in gene features and distribution, especially in strain-specific genes found predominately within one of the symbiotic megaplasmids of S. meliloti, pSymA. Synteny analysis showed varying presence of rctB, a plasmid transfer transcription regulator. The gene was not present in two organisms, S. meliloti AK83 and S. medicae WSM419; these two strains were shown to be susceptible to the antimicrobial effect of gallic acid (GA), indicating the importance of plasmid conjugation during symbiosis. Transcriptome analysis further supported this idea. We found that genes directly involved in plasmid transfer, such as traA relaxases and Type IV Secretion System (T4SS) proteins, genes present in pSymA, were substantially up-regulated during the N2-fixation phase of root nodulation. Protein sequence comparison showed considerable dissimilarity in proteins encoded by pSymA compared to the rest of the genome. The similar localization of plasmid transfer genes and the majority of strain-specific genes indicates the importance of the megaplasmid in determining plant-microbe compatibility and N2-fixation effectiveness. This study provides insight into the molecular differences between various strains of Sinorhizobium spp. influencing their symbiotic prowess and the potential basis for the control mechanisms of plant-microbe interactions. note de thèses : Mémoire de master en sciences biologiques A comparative genomics study of Sinorhizobium spp. strains highlighting the molecular mechanisms underlying partner specificity in rhizobia-legume symbiosis [document multimédia] / Mohamed Abdenour Rezzoug, Auteur ; Fathi Berrabah, Directeur de thèse ; Asma Rezzoug, Directeur de thèse . - Laghouat : Université Amar Telidji - Département de biologie, 2025 . - 50 p. + 1 disque optique numérique (CD-ROM). Option : Microbiologie Langues : Anglais Mots-clés : Rhizobia  Nodules  Plant phenolic compounds  Bacterial conjugation  Symbiosis Résumé : Bacteria from the genus Sinorhizobium can form a symbiotic relationship with various leguminous plants, such as the model legume Medicago truncatula. This plant-microbe association induces the formation of specialized plant organs called root nodules, inside which the bacteria perform symbiotic nitrogen fixation (SNF). Among the methods of controlling the symbiotic process by the plant is the secretion of phenolic compounds (PCs), which acts as signaling molecules and have a potential role in modulating bacterial communities as a defense mechanism during symbiotic nodulation. This study aims to elucidate some of the molecular mechanisms involved in the selection of plant growth promoting Rhizobacteria (PGPR) by the host and factors determining symbiont specificity. Phenolic acid bioassays coupled with a comparison of the Pan-Genome of various Sinorhizobium spp. strains revealed key differences in gene features and distribution, especially in strain-specific genes found predominately within one of the symbiotic megaplasmids of S. meliloti, pSymA. Synteny analysis showed varying presence of rctB, a plasmid transfer transcription regulator. The gene was not present in two organisms, S. meliloti AK83 and S. medicae WSM419; these two strains were shown to be susceptible to the antimicrobial effect of gallic acid (GA), indicating the importance of plasmid conjugation during symbiosis. Transcriptome analysis further supported this idea. We found that genes directly involved in plasmid transfer, such as traA relaxases and Type IV Secretion System (T4SS) proteins, genes present in pSymA, were substantially up-regulated during the N2-fixation phase of root nodulation. Protein sequence comparison showed considerable dissimilarity in proteins encoded by pSymA compared to the rest of the genome. The similar localization of plasmid transfer genes and the majority of strain-specific genes indicates the importance of the megaplasmid in determining plant-microbe compatibility and N2-fixation effectiveness. This study provides insight into the molecular differences between various strains of Sinorhizobium spp. influencing their symbiotic prowess and the potential basis for the control mechanisms of plant-microbe interactions. note de thèses : Mémoire de master en sciences biologiques

Étude de l’activité anticandidosique des extraits de l’algue marine rouge Asparagopsis armata / Maroua Abdellaoui

Public ISBD Titre : Étude de l’activité anticandidosique des extraits de l’algue marine rouge Asparagopsis armata Type de document : document multimédia Auteurs : Maroua Abdellaoui, Auteur ; Safa Abdellaoui, Auteur ; Ilhem Messahli, Directeur de thèse ; Asma Rezzoug, Directeur de thèse Editeur : Laghouat : Université Amar Telidji - Département de biologie Année de publication : 2024 Importance : 76 p. Accompagnement : 1 disque optique numérique (CD-ROM) Note générale : Option : Microbiologie appliquée Langues : Français Mots-clés : Asparagopsis armata  Candida albicans  activité anticandidosique  CMI Résumé : Cette étude vise à évaluer l'activité anticandidosique de deux extraits bruts de l'algue marine rouge Asparagopsis armata Harvey provenant de la côte nord de l’Algérie. Les extraits, obtenus par macération dans du méthanol et du dichlorométhane, ont été testés pour leur activité antifongique contre deux souches de Candida albicans, ATCC 10231 et ATCC 26426. L'activité anticandidosique a été mesurée en termes de zones d'inhibition en utilisant la méthode de diffusion en milieu gélosé en puits et sur disques. Parmi les extraits testés, l’extrait dichlorométhanique a montré le pouvoir anticandidosique le plus puissant. La concentration minimale inhibitrice (CMI) a également été déterminée pour les deux souches fongiques par la méthode de microdilution. L'extrait DCM de l'algue A. armata a montré un effet inhibiteur significatif contre les deux souches de C. albicans avec une CMI de 0,14 mg/ml pour les souches ATCC 10231 et ATCC 26426, par rapport à l'extrait méthanolique, qui a montré une CMI de 0,58 mg/ml pour les mêmes souches. Ces résultats suggèrent que l'extrait d'algue rouge marine pourrait représenter une source prometteuse de nouveaux agents anticandidosiques. note de thèses : Mémoire de master en sciences biologiques Étude de l’activité anticandidosique des extraits de l’algue marine rouge Asparagopsis armata [document multimédia] / Maroua Abdellaoui, Auteur ; Safa Abdellaoui, Auteur ; Ilhem Messahli, Directeur de thèse ; Asma Rezzoug, Directeur de thèse . - Laghouat : Université Amar Telidji - Département de biologie, 2024 . - 76 p. + 1 disque optique numérique (CD-ROM). Option : Microbiologie appliquée Langues : Français Mots-clés : Asparagopsis armata  Candida albicans  activité anticandidosique  CMI Résumé : Cette étude vise à évaluer l'activité anticandidosique de deux extraits bruts de l'algue marine rouge Asparagopsis armata Harvey provenant de la côte nord de l’Algérie. Les extraits, obtenus par macération dans du méthanol et du dichlorométhane, ont été testés pour leur activité antifongique contre deux souches de Candida albicans, ATCC 10231 et ATCC 26426. L'activité anticandidosique a été mesurée en termes de zones d'inhibition en utilisant la méthode de diffusion en milieu gélosé en puits et sur disques. Parmi les extraits testés, l’extrait dichlorométhanique a montré le pouvoir anticandidosique le plus puissant. La concentration minimale inhibitrice (CMI) a également été déterminée pour les deux souches fongiques par la méthode de microdilution. L'extrait DCM de l'algue A. armata a montré un effet inhibiteur significatif contre les deux souches de C. albicans avec une CMI de 0,14 mg/ml pour les souches ATCC 10231 et ATCC 26426, par rapport à l'extrait méthanolique, qui a montré une CMI de 0,58 mg/ml pour les mêmes souches. Ces résultats suggèrent que l'extrait d'algue rouge marine pourrait représenter une source prometteuse de nouveaux agents anticandidosiques. note de thèses : Mémoire de master en sciences biologiques

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Étude de la biodégradation du phénol par les bactéries isolées à partir du sol contaminé par les dérivées pétrolières / Asma Rezzoug

Public ISBD Titre : Étude de la biodégradation du phénol par les bactéries isolées à partir du sol contaminé par les dérivées pétrolières Type de document : texte manuscrit Auteurs : Asma Rezzoug, Auteur ; Hicham Gouzi, Directeur de thèse Editeur : Laghouat : Université Amar Telidji - Département de biologie Année de publication : 2022 Importance : 85 p. Format : 27 cm. Langues : Français Catégories : THESES :14 biologie note de thèses : Thèse de doctorat en sciences biologiques Étude de la biodégradation du phénol par les bactéries isolées à partir du sol contaminé par les dérivées pétrolières [texte manuscrit] / Asma Rezzoug, Auteur ; Hicham Gouzi, Directeur de thèse . - Laghouat : Université Amar Telidji - Département de biologie, 2022 . - 85 p. ; 27 cm. Langues : Français Catégories : THESES :14 biologie note de thèses : Thèse de doctorat en sciences biologiques

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thed 14-19	thed 14-19	Thése	SALLE DES THESES bibliothèque centrale	théses en biologie	Disponible

Étude de l'effet de champignons endophytes sur la tolérance au stress salin chez Arabidopsis thaliana / Fatima Zahra Babaghayou

Public ISBD Titre : Étude de l'effet de champignons endophytes sur la tolérance au stress salin chez Arabidopsis thaliana Type de document : document multimédia Auteurs : Fatima Zahra Babaghayou, Auteur ; Lina Nour Nouioua, Auteur ; Asma Rezzoug, Directeur de thèse Editeur : Laghouat : Université Amar Telidji - Département de biologie Année de publication : 2025 Importance : 45 p. Accompagnement : 1 disque optique numérique (CD-ROM) Note générale : Option : Microbiologie appliquée Langues : Anglais Mots-clés : Arabidopsis thaliana  Stress salin  Champignons endophytes  Fu11  Ch04 Résumé : Les interactions symbiotiques entre plantes et micro-organismes bénéfiques jouent un rôle essentiel dans l’adaptation des végétaux à leur environnement. Parmi ces micro-organismes, les champignons endophytes sont reconnus pour leur capacité à améliorer la croissance et la tolérance des plantes face aux stress abiotiques, notamment la salinité. Dans ce travail, nous avons étudié l’effet de deux champignons endophytes, Fu11 et Ch04, ainsi que de leur co-inoculation, sur Arabidopsis thaliana soumise à trois niveaux croissants de stress salin (0, 75 et 100 mM NaCl). Plusieurs paramètres morphologique et physiologiques ont été analysés : croissance racinaire, développement des racines secondaires, biomasse, nombre de feuilles, ainsi que les teneurs en chlorophylle a, b et totale. Les résultats révèlent que sous conditions non stressantes ou de stress modéré, les traitements fongiques, en particulier Ch04 et la co-inoculation Fu11+Ch04, améliorent significativement la croissance et le fonctionnement photosynthétique de la plante. Ces effets bénéfiques peuvent être attribués à des mécanismes tels que la modulation hormonale, l’augmentation de l’absorption des nutriments et la réduction du stress oxydatif. En revanche, sous stress salin sévère, l’efficacité des champignons est partiellement atténuée, bien que Ch04 maintienne une certaine activité protectrice. Ce travail met en évidence le potentiel des champignons endophytes comme partenaires symbiotiques pour renforcer la résilience des plantes en conditions salines, ouvrant des perspectives prometteuses pour une agriculture plus durable. note de thèses : Mémoire de master en sciences biologiques Étude de l'effet de champignons endophytes sur la tolérance au stress salin chez Arabidopsis thaliana [document multimédia] / Fatima Zahra Babaghayou, Auteur ; Lina Nour Nouioua, Auteur ; Asma Rezzoug, Directeur de thèse . - Laghouat : Université Amar Telidji - Département de biologie, 2025 . - 45 p. + 1 disque optique numérique (CD-ROM). Option : Microbiologie appliquée Langues : Anglais Mots-clés : Arabidopsis thaliana  Stress salin  Champignons endophytes  Fu11  Ch04 Résumé : Les interactions symbiotiques entre plantes et micro-organismes bénéfiques jouent un rôle essentiel dans l’adaptation des végétaux à leur environnement. Parmi ces micro-organismes, les champignons endophytes sont reconnus pour leur capacité à améliorer la croissance et la tolérance des plantes face aux stress abiotiques, notamment la salinité. Dans ce travail, nous avons étudié l’effet de deux champignons endophytes, Fu11 et Ch04, ainsi que de leur co-inoculation, sur Arabidopsis thaliana soumise à trois niveaux croissants de stress salin (0, 75 et 100 mM NaCl). Plusieurs paramètres morphologique et physiologiques ont été analysés : croissance racinaire, développement des racines secondaires, biomasse, nombre de feuilles, ainsi que les teneurs en chlorophylle a, b et totale. Les résultats révèlent que sous conditions non stressantes ou de stress modéré, les traitements fongiques, en particulier Ch04 et la co-inoculation Fu11+Ch04, améliorent significativement la croissance et le fonctionnement photosynthétique de la plante. Ces effets bénéfiques peuvent être attribués à des mécanismes tels que la modulation hormonale, l’augmentation de l’absorption des nutriments et la réduction du stress oxydatif. En revanche, sous stress salin sévère, l’efficacité des champignons est partiellement atténuée, bien que Ch04 maintienne une certaine activité protectrice. Ce travail met en évidence le potentiel des champignons endophytes comme partenaires symbiotiques pour renforcer la résilience des plantes en conditions salines, ouvrant des perspectives prometteuses pour une agriculture plus durable. note de thèses : Mémoire de master en sciences biologiques

Etude de la génétique des bactéries résistantes aux béta-lactamines / Meriem Akkouche

Public ISBD Titre : Etude de la génétique des bactéries résistantes aux béta-lactamines Type de document : document multimédia Auteurs : Meriem Akkouche, Auteur ; Ouahiba Khaldi, Auteur ; Asma Rezzoug, Directeur de thèse ; Ilhem Messahli, Directeur de thèse Editeur : Laghouat : Université Amar Telidji - Département de biologie Année de publication : 2024 Importance : 78 p. Accompagnement : 1 disque optique numérique (CD-ROM) Note générale : Option : Microbiologie appliquée Langues : Français Mots-clés : bétalactamines  bétalactamases  domaines transmembranaires  séquence consensus  arbres phylogénétiques  peptide signal  domaines fonctionnels importants Résumé : Les bactéries pathogènes ont atteint des niveaux alarmants de résistance vis à vis de nombreux antibiotiques dont les plus important les bétalactamines. De nouveaux mécanismes de résistance apparaissent et se propagent grace à l'évolution des enzymes de bétalactamases qui dégradent les bétalactamines en les convertissant en formes inactives. Cette étude vise à découvrir comment les bétalactamases évoluent et comment se développent pour résister aux antibiotiques à partir des séquences protéiques (étude in silico).Nous nous sommes appuyés sur une étude comparative des bétalactamases dans d'autres genres bactériens pourrait révéler des modèles évolutifs communs ou uniques, enrichissant notre compréhension de l'évolution des résistances aux antibiotiques dans différents environnements microbiens.Cette étude conclut à un ensemble des résultas dont les plus importants sont :Création d’une séquence consensus qui représente les caractéristiques essentielles partagées par toutes les bétalactamases étudiées.Génération des arbres phylogénétiques qui illustrent les relations évolutives entre les différentes bétalactamases et identifier les clades majeurs .Procéder a une analyse structurale de quelques protéines bétalactamases collecté(détection du peptide signal,détection des domaines transmembranaires, identification des domaines fonctionnels importants) ;pour comprendre les mécanismes moléculaires sous jacents à la fonction enzymatique des bétalactamases., ce qui peut expliquer leurs différences en termes de spécificité de substrat. note de thèses : Mémoire de master en sciences biologiques Etude de la génétique des bactéries résistantes aux béta-lactamines [document multimédia] / Meriem Akkouche, Auteur ; Ouahiba Khaldi, Auteur ; Asma Rezzoug, Directeur de thèse ; Ilhem Messahli, Directeur de thèse . - Laghouat : Université Amar Telidji - Département de biologie, 2024 . - 78 p. + 1 disque optique numérique (CD-ROM). Option : Microbiologie appliquée Langues : Français Mots-clés : bétalactamines  bétalactamases  domaines transmembranaires  séquence consensus  arbres phylogénétiques  peptide signal  domaines fonctionnels importants Résumé : Les bactéries pathogènes ont atteint des niveaux alarmants de résistance vis à vis de nombreux antibiotiques dont les plus important les bétalactamines. De nouveaux mécanismes de résistance apparaissent et se propagent grace à l'évolution des enzymes de bétalactamases qui dégradent les bétalactamines en les convertissant en formes inactives. Cette étude vise à découvrir comment les bétalactamases évoluent et comment se développent pour résister aux antibiotiques à partir des séquences protéiques (étude in silico).Nous nous sommes appuyés sur une étude comparative des bétalactamases dans d'autres genres bactériens pourrait révéler des modèles évolutifs communs ou uniques, enrichissant notre compréhension de l'évolution des résistances aux antibiotiques dans différents environnements microbiens.Cette étude conclut à un ensemble des résultas dont les plus importants sont :Création d’une séquence consensus qui représente les caractéristiques essentielles partagées par toutes les bétalactamases étudiées.Génération des arbres phylogénétiques qui illustrent les relations évolutives entre les différentes bétalactamases et identifier les clades majeurs .Procéder a une analyse structurale de quelques protéines bétalactamases collecté(détection du peptide signal,détection des domaines transmembranaires, identification des domaines fonctionnels importants) ;pour comprendre les mécanismes moléculaires sous jacents à la fonction enzymatique des bétalactamases., ce qui peut expliquer leurs différences en termes de spécificité de substrat. note de thèses : Mémoire de master en sciences biologiques

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MB 02-207	MB 02-207	CD	BIBLIOTHEQUE DE FACULTE DES SCIENCES	théses (sci)	Disponible

Isolement et identification des bactéries à partir d'un site contaminé par les dérivées pétroliers et l'étude de la biodégradation / Asma Rezzoug

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Protection of Alfalfa from salt stress using Endophytic bacteria / Rania Berkai

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